Apache Spark - Cache와 Persistence

Yeo Myung Ro·2022년 2월 18일
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Apache-Spark

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러닝스푼즈 - Practical Spark 강의스파크 완벽 가이드 를 요약한 내용입니다.

Cache

  • Spark 데이터 가공을 빠르고 효율적으로 하기 위한 기능
  • Spark는 논리적인 수준에서 데이터를 파티션 단위로 나누어 처리



이미지 출처

  • 개별 Executor 내의 설정에 의해 허용된 메모리량 만큼 Partition 데이터를 캐싱하는 것이 가능

  • BlockManager에 의해 관리

  • 만약 데이터가 메모리에 들어가기 충분하지 않으면 Disk를 사용할 수 있음

  • cache() 함수는 persist(storageLevel = MEMORY_AND_DISK) 함수와 동일 (참고 : Storage Level )

    # 첫번째 Action
    df.count()
    
    # cache
    dfCached = spark.read.format("parquet").load("./airbnb_listings_parquet").cache()
    
    # 두번째 Action
    dfCached.count()
    dfCached.rdd.getNumPartitions()
  • cache() 함수 사용 시,

    • Spark Executor 내에 분산되어 DataFrame이 저장

    • storageLevel = MEMORY_AND_DISK이므로 메모리가 부족할 경우 Disk를 사용할 수 있음

    • Executor 탭에서는 cache를 호출하기 이전에 비해 Storage Memory가 늘었음

    • Storage 탭에서는 197개 만큼의 Cached Partitions이 7.1MB 만큼 메모리에 존재(=파티션 숫자와 동일)

    • SQL 탭에서 나오는 두 개의 count() Action을 살펴보면 두번째 count() 호출, 즉 dfCached.count()에 InMemoryTableScan이라는 단계가 추가되었음

    • 좌측의 Details for Query 0 은 cache() 를 호출하지 않은 df.count() 의 실행 계획이고, 우측의 Details for Query 1 은 cache() 를 호출한 dfCached() 의 실행 계획이라는 단계가 추가

    • 하단의 Details 버튼을 누르거나 explain("FORMATTED") 를 통해 텍스트로 된 실행 계획을 확인 시

    • InMemoryTableScan 을 통해 데이터를 다시 Parquet 로 부터 읽지 않고 메모리에 캐싱된 영역에서 데이터를 읽어 집계

    • 더이상 해당 데이터를 캐싱해서 사용하지 않는다면 unpersist() 함수를 통해 제거 가능

      			dfCached.unpersist()
      			```

Persistence

  • Spark 는 다양한 형태의 파일을 읽어 DataFrame, 즉 테이블 형태의 논리적인 추상을 제공
    • 수 많은 파일들을 묶어, 하나의 테이블처럼 사용 가능
    • 대규모 처리가 필요할 경우 원하는 수준으로 Partition 을 분할해 복수 개의 Executor 에서 나누어 처리
    • CSV 뿐만 아니라 JSON, Parquet, JDBC 등에서 데이터를 읽어 여러 DataFrame 을 만든뒤 Join 을 수행해 복합적인 데이터 가공 및 분석도 가능

CSV & JSON

# CSV 파일 읽기
dfListing = spark.read.load("./airbnb_listings.csv",
				                    format="csv",
				                    inferSchema=True,
				                    header=True,
				                    quote='"',
				                    escape='"',
				                    sep=',',
				                    multiline=True)

# JSON 파일 읽기
dfListingJson = spark.read.format("json").load("./airbnb_listings")
  • Spark는 JSON 파일을 읽으면서 각 칼럼의 타입을 추론
    • csv 파일을 읽을 때 inferSchema=True 설정해주면 각 칼럼의 타입을 추론
  • 칼럼 타입을 정하려면 각 칼럼 별로 전체 값을 읽어야 함
  • 따라서 파일이 매우 크고 이미 타입을 알고 있다면 추론을 Spark가 하는 대신 primitivesAsString 값을 이용해 String으로 값을 세팅하고 cast() 등의 함수를 이용해 직접 타입을 지정하면 추론에 들어가는 시간을 줄일 수있음

Parquet, ORC - Columnar Format

  • 데이터를 빠르게 가공하기 위해선 CPU, Memory와 같은 리소스와 Spark같은 분산 처리 프레임워크도 중요하지만, 데이터가 어디에 어떻게 저장되어 있는지도 매우 중요

Parquet의 장점

  • 압축률이 좋음
    • 칼럼 단위로 구성하면 데이터가 균일하므로 압축률이 높아 파일의 크기가 작음
  • 디스크 I/O가 적음
    • 칼럼 단위로 데이터가 저장되어 필요한 칼럼만 읽음
    • 선택하지 않은 칼럼의 데이터는 디스크에서 읽지 않기 때문에 디스크 I/O가 적음
  • 칼럼 별로 적합한 인코딩 사용
    • 각 칼럼의 데이터들은 동일한 타입의 데이터를 저장하기 때문에 칼럼마다 데이터 타입에 유리한 인코딩을 사용할 수 있음
  • (Column Pruning) 대부분의 경우, 데이터는 몇몇 칼럼 단위로 이용되므로 SELECT a, b 칼럼 기준으로 데이터를 읽을 수 있다면 I/O 등 물리 비용을 줄일 수 있음
  • (Column Encoding) 칼럼 중심으로 데이터를 저장할 경우 타입에 특화된 인코딩을 통해 저장 공간을 줄일 수 있음
  • (Predicate PushDown) 데이터를 Spark로 가져오기 전 미리 필터링이 가능해 네트워크 비용을 포함한 데이터 가공 비용을 크게 줄일 수 있음
  • 컴퓨팅 프레임워크 구현에 따라 벡터화된 연산이 가능
    • 한 번에 한 Row 만 연산을 수행하는 것이 아니라 다수의 Row를 묶어 덧셈을 수행하는 등 묶음 연산을 통해 컴퓨팅 시간을 줄일 수 있음
    • Spark, Hive 에서는 Parquet를 통한 벡터화 연산을 지원

Parquet 파일 포맷으로 데이터를 저장하면, 내부적으로는 Row를 묶어 Row Group을 만들어 저장
Row Group 내의 각 칼럼 별로 통계치를 가질 수 있음

  • Column Pruning(혹은 Projection Pushdown) 을 이용해 필요한 칼럼 값만 뽑아내고
  • Predicate Pushdown을 이용해 Row 그룹 내 값을 미리 필터링 할 수 있음
    • WHERE A < 2 라는 조건이 있다면, Row Group 2번은 읽지 않을 수 있음

이미지 출처

  • 하나의 Row Group 내에는 Column Chunk가 여러 개 존재하며, Column Chunk는 다시 여러 개의 Page로 구성
  • Parquet는 파일의 Footer Metadata 내에 칼럼의 통계 정보를 가지고 있음

이미지 출처

# Parquet 파일 읽기
dfListingParquet = spark.read.format("parquet").load("./airbnb_listings")

Parquet Files

Avro - Data Serialization

  • Apache Avro는 데이터 직렬화 도구
  • JSON을 전송하고 받아서 사용하는 것에 비해 Avro, Protobuf, Thrift와 같은 중립적인 데이터 직렬화 시스템을 사용하는데는 몇가지 이유가 있음
    • 언어 중립적이므로 어떤 언어를 사용하는지 상관없이 직렬화 도구가 지원한다면 다양한 언어로 데이터를 읽고 쓸 수 있음 (e.g, Kafka Producer & Consumer)
    • 스키마를 미리 정의하고 사용하므로 실수로 변경될 부분을 방지하고 미래의 변경도 기존 소비자 (Consumer 등) 를 위한 스키마 호환을 (Avro Schema Evoluation) 지원
    • 타입이 정해져 있으므로 Encoding 을 통한 사이즈 축소 및 효율적인 조회 (Columnar 의 경우 Colume Pruning, Predicate Pushdown 등) 이 가능
    • Thrift, ProtoBuf (gRPC) 와 같은 프레임워크는 RPC API 를 제공

많은 경우에 다음과 같이 사용

  • S3, HDFS 등에 저장된 대규모의 읽기를 위한 데이터는 Parquet, ORC 등 읽기 및 압축 효율이 좋은 Columnar 포맷을 사용
    • 읽기가 빈번하고 사이즈가 매우 커질 수 있기 때문
  • Kafka / API 등 실시간으로 데이터를 주고 받는 경우에는 Avro 처럼 Schema 관리가 편리하거나 (Registry 등 도구 제공) Protobuf w/ gRPC 처럼 통신을 위한 라이브러리가 지원되는 포맷을 활용하는 경우가 많음

단점

  • 멀쩡한 데이터를 Header (Schema / Meta) + Payload (Data) 로 변경하고 인코딩을 수행해야 하므로 CPU 리소스를 사용
  • 다만 사이즈는 작아질 수 있기에 네트워크 비용에서 이점을 볼 수 있음

Avro 를 사용하기 위해서는

  • Data Serialization 포맷은 IDL (Interface Definition Language) 이라 불리는 스키마 파일을 작성
  • Protobuf / Thrift / Avro 의 경우에는 IDL 을 바탕으로 코드를 생성

Avro 의 경우에는 다른 프레임워크와 다르게, Data 자체에 Schema 를 포함

  • 따라서 코드 생성을 통해 빌드 타임에 데이터 클래스를 생성할 수 있지만 (Avro SpecificRecord)
  • 런타임에도 Deserialization 을 수행
    • 다만 런타임에 예외가 발생할 수 있음 (Avro GenericRecord)
  • 피치 못한 경우가 아니라면 빌드 타임에 데이터 클래스를 생성해 사용하는 편이 좋음

Avro 는 주로 Kafka 와 함께 활용

  • Avro 로 Serialized 된 데이터를 Kafka Broker 로 직접 보내고 읽을 수 있음
  • 만약 Schema Registry 를 이용하면 업타임에 Producer / Consumer 에서 스키마를 등록하거나 받아올 수 있음
  • Confluent Schema Registry 의 경우 Avro 뿐만 아니라 Protobuf, JSON 형식의 스키마도 지원

이미지 출처

JDBC(MySQL, Postgres 등)

  • Generic Load / Save 함수를 이용하면 JDBC드라이버를 이용해 MySQL과 같은 RDB에 데이터를 넣을 수 있음
  • Spark가 쓸 수 있도록 JDBC Driver를 Spark Class Path에 추가해주어야 함

JDBC Write 설정

  • mode
    • 기존 File을 write하는 것과 매우 다르게 동작
    • overwrite를 사용하면 기본 설정으로는 Table을 Drop하고 DataFrame의 Schema를 기반으로 테이블을 다시 생성
    • 따라서 Index 등 중요한 설정 정보가 삭제될 수 있어서 매우 유의해 사용
  • truncate = True
    • mode = overwrite라 하더라도 테이블은 삭제하지 않고 데이터만 삭제
    • 그러나 여전히 데이터가 통채로 삭제될 수 있어 서비스 중인 DB에서는 문제가 될 수 있음
  • numPartitions
    • 이 값은 JDBC 커넥션 숫자로, repartition(3)이고 numpartitions(2)인 경우 coalesce(2 = numPartitions)를 통해서 파티션 숫자를 줄인 후 Executor 마다 JDBC Connection 1개 씩을 할당해 Write
  • 일반적으로 mode = append를 이용하고 Update나 Upsert가 필요한 경우 다른 방식으로 구현
    • foreach 내 직접 Statement 실행 등

JDBC Read 설정

  • partitionColumn
    • 명시된 칼럼을 이용해 numPartitions 숫자만큼 분산처리 가능
    • lowerBound, uppserBound는 각 파티션 당 얼마나 많은 데이터를 가져올지 분할량(파티셔닝)을 결정
    • 칼럼 타입은 RA numeric(숫자), date, timestamp 값만 가능
  • customSchema
    • 칼럼별 스키마를 지정
    • Spark는 RDB스키마를 Spark 호환 타입으로 변경하나, 일부 지원되지 않는 타입이나 잘못 변경될 경우 customSchema 옵션을 이용하거나 직접 DataFrame에서 cast() 함수를 사용
  • fetchsize
    • 너무 작으면 여러번 네트워크 통신이 필요하고 너무 많으면 DB에 부하가 갈 수 있음
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# data engineering

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